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name: sci-reference-audit description: | SCI级文献真实性与引用一致性审计工具。对学术论文参考文献列表进行系统性联网核查， 验证文献真实性、DOI有效性、作者/标题/期刊/年份/卷期页准确性， 识别AI伪造文献，生成10节标准Markdown审计报告。 核心特色：多轮次验证、多数据源交叉、多Agent并行互查、审计后自学习。 触发词：审计文献、文献真实性、reference audit、查文献、验证引用、核查参考文献、 文献核实、文献校验、假文献检测、SCI文献审计 allowed-tools:

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SCI级文献真实性与引用一致性审计

对学术论文参考文献列表进行系统性联网核查，达到SCI期刊投稿前审计标准。 核心原则：多轮次、多数据源、多Agent互查——任何单一来源的结论不可采信。

适用场景

• 学术论文投稿前参考文献全面核查
• 识别AI伪造/幻觉文献
• 补全缺失的DOI、卷期页、作者列表
• 修正期刊名错误或缺失
• 标准化引用格式（Vancouver/AMA）
• 核查正文引用位置与参考文献的一致性
• 检测重复引用、编号错误等结构性问题

输入要求

用户需提供以下至少一项：

1. 文献列表文件（.txt/.md/.docx）：包含待审计的参考文献
2. 直接粘贴的文献列表：在对话中直接提供
3. 含文献列表的论文正文：可同时进行引用位置审计

可选提供：

• 正文文件（用于引用位置核查）
• 指定审计范围（如"只查[1]-[10]"）
• 指定引用格式（默认Vancouver/AMA）
• 目标期刊（用于匹配特定期刊的引用格式要求）

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核心工作流：7阶段+多轮多源多Agent+自学习

┌──────────────────────────────────────────────────────────────────────┐
│  阶段〇：预检（结构性质检，不需联网）                                    │
│  ↓                                                                    │
│  阶段一：解析与分组                                                     │
│  ↓                                                                    │
│  阶段二：多Agent并行初查（第一轮）← Agent-PubMed / Agent-CrossRef 并行  │
│  ↓                                                                    │
│  阶段三：多源交叉复核（第二轮）← 不同来源验证第一轮结果                    │
│  ↓                                                                    │
│  阶段四：冲突仲裁与深度验证（第三轮）← Agent-Referee 解决冲突            │
│  ↓                                                                    │
│  阶段五：AI伪造识别 + 假文献替换                                        │
│  ↓                                                                    │
│  阶段六：正文引用位置核查                                               │
│  ↓                                                                    │
│  阶段七：报告生成 + 全局一致性检查 + 审计后自评 + 教训回流               │
└──────────────────────────────────────────────────────────────────────┘

阶段〇：预检（Pre-flight Check）

在正式审计前，先执行结构性质检，这些检查不需要联网，可立即完成：

1. 编号连续性检查：[1],[2],...无跳号/重复/格式不统一
2. 重复引用检测：
   • 完全重复（作者+标题+期刊完全相同）
   • 变体重复（同一论文不同格式）
   • 检测方法：标题相似度 + 第一作者+年份+期刊组合去重 + DOI比对
3. 排序检查：Vancouver按正文首次出现顺序；无正文按作者姓氏

预检输出：

📋 预检结果
- 总文献数：22条
- 编号连续性：✅ 连续 / ❌ 发现跳号[3]
- 重复引用：✅ 无重复 / ❌ [7]与[12]为同一论文
- 排序规则：按正文出现顺序 / 按作者姓氏
- 著录完整性：A级3条 / B级8条 / C级9条 / D级2条

阶段一：解析与分组（Parse & Partition）

1. 逐条解析参考文献，提取结构化字段：编号、作者、标题、期刊、年份、卷(期):页、DOI、PMID
2. 识别著录完整性等级：A级完整 / B级部分完整 / C级严重不完整 / D级仅标题+作者
3. 优先审计C/D级（高风险），再审计A/B级

阶段二：多Agent并行初查（第一轮 — Round 1）

启动2-3个独立Agent，各自使用不同数据源，对同一批文献并行核查。

| Agent | 主数据源 | 辅助数据源 | 适用文献 | |-------|----------|-----------|----------| | Agent-PubMed | PubMed E-utilities API | PubMed网页搜索 | 全部生物医学文献 | | Agent-CrossRef | CrossRef API | Europe PMC API | 全部文献（侧重DOI） | | Agent-Journal | 期刊官网/出版商 | Google Scholar | 高风险文献 |

≤8条文献：2个Agent；>20条：按5-8条一组分配。

Agent Prompt模板：参见 references/agent_prompts.md

Agent结果整合：对每条文献构建多源对照表：

| 字段 | Agent-PubMed | Agent-CrossRef | 是否一致 | |------|-------------|---------------|----------|

判定规则：

• ✅ 两源一致 → 采信，标记"双源确认"
• ⚠️ 两源不一致 → 进入阶段四冲突仲裁
• ❌ 某源无法检索到 → 以另一源为准，标记"单源确认，待复核"
• ⚠️ 同一文献部分字段一致、部分不一致 → 一致字段采信，不一致字段进入阶段四仲裁

阶段三：多源交叉复核（第二轮 — Round 2）

对第一轮中所有"发现问题的文献"执行交叉验证。核心规则：第一轮用PubMed的→第二轮必须用CrossRef/期刊官网；反之亦然。

交叉验证矩阵：

| 第一轮主数据源 | 第二轮验证数据源 | |----------------|-----------------| | PubMed | CrossRef + 期刊官网 | | CrossRef | PubMed + PMC | | PubMed无结果 | Europe PMC + Google Scholar | | Agent间结果不一致 | 期刊官网（权威来源） |

结果分类：三源一致 → 最高置信度 | 双源一致 → 确认 | 单源确认 → 待手动确认 | 源间冲突 → 仲裁 | 全源无果 → AI伪造检测

阶段四：冲突仲裁与深度验证（第三轮 — Round 3）

当Agent间出现结果冲突时，启动独立仲裁Agent（Agent-Referee）解决。

仲裁规则：

| 冲突类型 | 仲裁规则 | |----------|----------| | 卷期页冲突 | 以PubMed正式记录为准 | | 年份冲突 | 以PubMed正式卷期年份为准；检查Epub vs正式出版 | | 期刊名冲突 | 以PubMed ISOAbbreviation（NLM缩写）为准 | | DOI冲突 | 以CrossRef为准（DOI注册机构），实际解析两个DOI确认 | | 作者列表冲突 | 以PubMed为准，按Vancouver格式截取 | | 标题微小差异 | 以PubMed完整标题为准（含副标题） |

Agent-Referee Prompt模板：参见 references/agent_prompts.md

最终确认检查（所有文献）：

1. DOI解析验证：访问 https://doi.org/[DOI] 确认返回正确论文
2. 回溯验证：用修正后的完整元数据在PubMed搜索确认

阶段五：AI伪造文献识别

前提：文献在所有Agent和所有来源中均无法检索到。

AI伪造特征检查清单（7项）：过于完美的标题 / 不可验证的作者 / 不可验证的机构 / 期刊-内容不匹配 / DOI/PMID缺失且不可查 / 年份异常 / 引用量异常

判定流程：

• 2-3个来源无结果 + 3个以上AI特征 → ❌ 高度疑似AI伪造
• 所有来源无结果 + 5个以上AI特征 → ❌❌ 确认AI伪造

假文献替换：报告判定理由 → 提取正文引用意图 → 搜索替代文献 → 推荐2-3篇替换候选 → 用户决定

阶段六：正文引用位置核查

仅在用户提供了正文时执行。

一致性判断：✅一致 / ⚠️部分一致 / ❌不一致 / ❌过度推断 / ❌引而未用

额外检测：未引用检测（参考文献在正文中未被引用）

阶段七：报告生成 + 全局一致性检查 + 审计后自评

1. 生成标准10节Markdown报告，默认 reference_audit_report.md
2. 执行全局一致性检查（见下方清单）
3. 审计后自评：参见 references/quality_self_assessment.md
4. 教训回流：从本次审计中提炼新教训，写入 references/audit_lessons.md

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置信度评分体系

每条文献的每个字段都有独立的置信度评分。

| 等级 | 定义 | 采信规则 | |------|------|----------| | A | 三源确认 | 直接采信 | | B | 双源确认 | 采信，附注 | | C | 单源确认 | 采信但标记"⚠️ 建议手动确认" | | D | 仲裁确认 | 采信但标记"⚠️ 建议手动确认" | | E | 无法验证 | 不修改原文 | | F | 确认伪造 | 标记假文献，推荐替换 |

文献总体置信度取所有字段中的最低置信度。

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多Agent并行执行策略

| 文献数量 | Agent数量 | 分配策略 | |----------|----------|----------| | ≤5条 | 2 | Agent-PubMed + Agent-CrossRef 各查全部 | | 6-15条 | 2-3 | 按编号平分，高风险文献启动第3个 | | 16-30条 | 3 | 分3组（前1/3 + 中1/3 + 后1/3），各分配1组Agent | | >30条 | 3+ | 按8条一组分配，分批启动 |

Agent并行关键原则：

1. 独立运行：互不干扰
2. 统一输入：完全相同的原始文献列表
3. 结果汇总：主Agent构建对照表
4. 冲突上报：任何错误必须经另一Agent/数据源交叉验证
5. 单源禁改：实质性修正需≥2个独立来源

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报告格式规范

报告必须包含10个章节。详细格式规范参见 references/report_format.md。

章节概要：

1. 总体审计摘要 — 统计表 + 总体可信度评级 + 多源验证统计
2. 逐条文献审计报告 — 每条10个子节（原始文献/Agent-PubMed/Agent-CrossRef/对照表/交叉复核/冲突仲裁/最终确认/存在问题/修正后文献/查询来源）
3. 查询网址列表 — 含使用Agent标注
4. 网址信息提取列表 — 完整元数据
5. 文献简报列表 — 含置信度
6. 前后修正对比表 — 含置信度
7. 最终可信参考文献列表 — 可直接复制使用
8. 正文引用位置核查列表 — 如有正文
9. 高风险问题列表 — 含风险等级和置信度
10. 最终审计结论 — 含多轮多源验证完整性声明

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引用格式标准

详细规范参见 references/citation_format.md。核心要点：

• Vancouver/AMA格式：作者列表. 标题. 期刊缩写. 年份;卷(期):起页-止页. doi: 10.xxxx/xxxxx.
• 作者：姓+名缩写无句点；≤6全部列出，>6用et al.；中间名首字母保留（如Karway GK）
• DOI格式：doi: 10.xxxx/xxxxx（非DOI: 或 https://doi.org/）
• 期刊缩写：NLM标准，速查参见 references/journal_abbreviations.md

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审计纪律（Critical Rules）

❗ 绝对禁止

1. 禁止凭记忆判断 — 所有结论基于联网检索
2. 禁止猜测修正 — 不确定则标记"待手动确认"
3. 禁止伪造URL — 所有URL必须是实际访问过的
4. 禁止盲目修改正确内容 — 原文正确不得"修正"为错误
5. 禁止单源修正 — 实质性修正需≥2个独立来源
6. 禁止单Agent定论 — 错误结论须经另一Agent/数据源交叉验证

⚠️ 特别注意

1. 作者缩写：PubMed "George K Karway" → Vancouver "Karway GK"（中间名首字母保留）
2. 在线发表vs正式出版：以正式卷期年份为准
3. 中文文献：拼音作者名+英文标题+Chin Med J格式；CNKI/万方补充验证
4. 姐妹刊混淆：JAMA系列/Lancet系列/Nature系列/KI系列——必须核对ISSN
5. 多Agent结果整合：绝不凭一个Agent结果修改原文，必须构建对照表

✅ 质量保障

1. 双源验证 / 逐条复核 / 全局一致性 / 多Agent互查
2. 用户反馈 → 立即启动2个Agent独立验证 → 承认错误 → 全局修正
3. 审计后自评：参见 references/quality_self_assessment.md
4. 教训回流：每次审计后提炼新教训，写入 references/audit_lessons.md

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报告全局一致性检查清单

修正任何条目后必须逐一检查：

• [ ] 章节一：统计数字 + 多源验证统计
• [ ] 章节二：该条10个子节
• [ ] 章节三：是否需补充URL + Agent标注
• [ ] 章节四：该条信息
• [ ] 章节五：该条简报 + 置信度
• [ ] 章节六：修正前后对比 + 置信度
• [ ] 章节七：该条最终引用
• [ ] 章节九：是否需增删 + 置信度
• [ ] 章节十：统计和建议 + 多源验证声明

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参考文件索引

| 文件 | 内容 | 何时加载 | |------|------|----------| | references/agent_prompts.md | Agent-PubMed/CrossRef/Journal/Referee的完整Prompt模板 | 启动Agent时 | | references/audit_lessons.md | 实战教训库（教训1-N，持续积累） | 审计全程参照 | | references/journal_abbreviations.md | NLM期刊缩写速查表+易混淆对比 | 验证期刊名时 | | references/search_templates.md | 搜索策略矩阵+API查询模板+决策树+Semantic Scholar | 执行搜索时 | | references/quality_self_assessment.md | 审计后自评+教训回流+增量审计+版本管理 | 报告生成后 | | references/citation_format.md | 完整引用格式规范+特殊类型+姐妹刊警示 | 生成报告时 | | scripts/verify_dois.py | 批量DOI解析验证脚本 | 第三轮最终确认 |

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任务管理

超过10条文献时，使用TaskCreate创建分阶段任务：

1. 预检+解析文献列表
2. 多Agent并行初查（第一轮）
3. 多源交叉复核（第二轮）
4. 冲突仲裁与深度验证（第三轮）
5. AI伪造识别+假文献替换
6. 生成审计报告
7. 全局一致性复查 + 审计后自评

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使用示例

| 场景 | 用户输入 | 工作流 | |------|----------|--------| | 基础审计 | 审计文献.txt中的文献真实性 | 预检→解析→多Agent初查→交叉验证→仲裁→报告→自评 | | 指定范围 | 核查参考文献[9]-[16] | 2个Agent并行→交叉验证→更新报告 | | 含正文 | 审计引用准确性，正文main.md，文献ref.txt | 多Agent核查+引用位置匹配 | | 快速验证 | 验证Tangri N 2011 JAMA的DOI | PubMed+CrossRef双源确认 | | 假文献检测 | 检查有没有假文献 | 多Agent核查→AI伪造检查→替代推荐 | | 格式标准化 | 统一成Vancouver格式 | 解析→补全→标准化 | | 用户反馈 | 第22条你们给的不对 | 2个Agent独立验证→承认错误→全局修正 |

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错误处理

| 情况 | 处理 | |------|------| | 所有来源无法检索 | AI伪造特征检查→标记疑似假文献 | | CrossRef与PubMed不一致 | PubMed为准+Agent-Referee仲裁 | | DOI解析返回不同论文 | 标记不匹配+双源确认修正 | | Agent间结果冲突 | Agent-Referee仲裁 | | 某Agent报告错误但另一Agent未发现 | 第三来源验证——不能忽略 | | 用户指出报告错误 | 立即2个Agent独立验证+全局修正 | | 期刊网站反爬虫 | PubMed/CrossRef替代+标记"来源受限" | | Agent超时/中断 | 标记该Agent负责的文献为"未完成"，用另一Agent补查+标记"单源确认" | | 大量文献(>30)分批超时 | 按批次保存中间结果到审计日志，断点续审 |

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重复引用检测阈值

判断两条文献是否为同一论文的不同格式：

| 判定条件 | 判定结果 | |----------|----------| | DOI相同 | ❗ 确认重复（同一论文） | | 第一作者姓氏+年份+期刊+卷期页完全相同 | ❗ 高度疑似重复 | | 标题规范化后（去标点/空格/大小写）相似度≥90% | ⚠️ 疑似重复，需人工确认 | | 仅作者+年份相同但标题/期刊不同 | ✅ 非重复（同年同作者不同论文） |

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审计结果交付

1. deliver_attachments 发送报告文件
2. open_result_view 呈现报告
3. 口头摘要（3-5句）：总体评级 + 最严重问题 + 多源验证覆盖率 + 需手动确认项 + 下一步建议

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配置选项

| 选项 | 默认值 | 说明 | |------|--------|------| | 引用格式 | Vancouver/AMA | 可指定APA/Harvard | | 审计深度 | 三轮+多Agent | 可简化（会降低置信度） | | 并行Agent数 | 2-3 | 按文献数量自动调整 | | 最少验证来源数 | 2 | 实质性修正最低来源数 | | AI伪造检测 | 开启 | 可关闭以加速 | | 替换文献推荐 | 开启 | 检测到假文献时搜索替代 |

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版本历史

| 版本 | 日期 | 变更 | |------|------|------| | 3.3.0 | 2026-05-24 | 全面质检修复：修正Semantic Scholar速率限制数据（无密钥100次/5min，非1000次）；verify_dois.py标题子串匹配增加60%长度阈值防误匹配；16-30条Agent分配策略明确为3组（非2组）；教训13/14消除与SKILL.md规则重复改为侧重经验洞察；补充PubMed E-utilities速率限制（3次/秒）；自评检查清单9→10章节；Agent结果整合增加"部分字段不一致"处理规则；report_format.md补充Corrected (D-grade)状态；Agent-Journal查询方式补充Semantic Scholar；期刊缩写表BMJ全称去The；教训库数量描述改为N条（持续积累） | | 3.2.0 | 2026-05-24 | 精细化修复：修正错别字（章业九→章节九）；统一状态命名（Corrected Single-Source→Corrected C-grade）；Agent Prompt明确指定general-purpose类型；补充Agent超时/中断处理；补充重复引用检测量化阈值；补充Semantic Scholar API；CrossRef礼貌池说明；clarify参考文献索引描述 | | 3.1.0 | 2026-05-24 | 自学习升级：添加agent_created标记；Agent Prompt移入references/；新增审计后自评+教训回流+增量审计+版本管理+审计日志+质量自评清单（quality_self_assessment.md）；新增批量DOI验证脚本（verify_dois.py）；SKILL.md精简为核心工作流+规则 | | 3.0.0 | 2026-05-24 | 多Agent并行互查+置信度评分+7阶段工作流+冲突仲裁 | | 2.1.0 | 2026-05-24 | 预检+AI伪造识别+PubMed E-utilities+全局一致性清单 | | 2.0.0 | 2026-05-24 | 初始版本 |