Synthèse automatique
Interroge des notes cliniques via la CLI trioexplorer : recherche par mot-clé, sémantique ou hybride, listage des cohortes et consultation de l'historique des recherches.
Points forts
- Trois modes de recherche (keyword, semantic, hybrid) avec reranking sémantique et pondération vectorielle réglables
- Filtrage par cohortes et sorties au format table, JSON ou CSV, exploitable directement dans le terminal
- Commandes de découverte (cohorts, notetypes, entities, filters) et statistiques d'historique pour explorer la base
Limites
- Suppose que la CLI trioexplorer soit installée et que la variable TRIOEXPLORER_API_KEY soit définie
- Aucune indication sur le traitement des données patients, la confidentialité ou l'audit des accès
- La pagination de la recherche se limite à l'option -k, sans mécanisme de page documenté
Quand l'utilisateur veut rechercher des notes cliniques, lister des cohortes ou consulter l'historique des recherches dans la base Trioexplorer.
Si la CLI n'est pas installée, si la clé API est absente ou si l'utilisateur n'a pas accès aux données cliniques concernées.
Analyse de sécurité
PrudenceNothing here is destructive or exfiltrating: there are no curl|sh pipes, no rm -rf, no base64 payloads, and no attempts to disable safeguards. The risk profile is that of a legitimate but powerful wrapper around a clinical-data CLI — it runs arbitrary shell commands against a PHI store and offers a debug mode that may log sensitive content. That lands in 'caution' rather than 'safe', and users should treat outputs and logs as regulated data.
- •Skill grants Bash and drives a CLI that queries a clinical-notes database, so it operates on highly sensitive PHI; no guardrails are documented around de-identification, retention, or where output is written.
- •The `--debug` global flag enables request/response logging, which could persist patient note text or API responses to disk/logs unbidden.
- •Requires `TRIOEXPLORER_API_KEY` in the environment; the skill does not instruct the agent to avoid echoing or persisting the key, and `--debug` output could expose auth headers.
- •Commands are invoked by bare name (`trioexplorer`), so the binary resolved from PATH is implicitly trusted; no provenance/version check is described.
- •Unrestricted query/cohort/user-id arguments are passed straight to the CLI, allowing broad enumeration of cohorts, entities, and other users' search history.
Exemples
Search the clinical notes for patients having trouble with blood sugar control, using semantic search and return 20 results as JSON.Within cohorts abc123 and def456, find notes mentioning chest pain and show the full note text.List the available cohorts and note types in trioexplorer, then show my recent search history.name: trioexplorer description: Search clinical notes using the Trioexplorer CLI. Use when the user wants to search patient notes, list cohorts, view search history, or explore the clinical notes database. allowed-tools: Bash
Trioexplorer CLI
Search clinical notes using the trioexplorer CLI. The CLI requires TRIOEXPLORER_API_KEY to be set.
Commands
Search clinical notes
trioexplorer search "query" [options]
Options:
-k N— Number of results (default: 10)--type TYPE— Search type:keyword,semantic, orhybrid(default)--cohort-ids IDS— Comma-separated cohort IDs to search--format FORMAT— Output:table(default),json, orcsv--full-text— Show full note text--rerank false— Disable semantic reranking--vector-weight N— Weight for vector vs keyword (0.0-1.0)
List resources
trioexplorer list cohorts [--limit N]
trioexplorer list notetypes [--search TEXT]
trioexplorer list history [--page N] [--user-id ID]
trioexplorer list entities
trioexplorer list filters [--field NAME]
Statistics
trioexplorer stats history [--date-from DATE] [--date-to DATE]
Global options
--debug— Enable request/response logging--help— Show help for any command
Examples
Search for diabetes-related notes:
trioexplorer search "diabetes management" -k 20
Semantic search with JSON output:
trioexplorer search "patient having trouble with blood sugar" --type semantic --format json
Search within specific cohorts:
trioexplorer search "chest pain" --cohort-ids abc123,def456
Task: $ARGUMENTS
Du fichier au premier essai
Le téléchargement contient exactement le contenu affiché sur cette fiche. Cette copie peut différer de la dernière version du dépôt source.
Consulter la source et ses fichiers annexesCe téléchargement contient uniquement SKILL.md. Les scripts, références, modèles et dépendances éventuels ne sont pas inclus. Récupérez les fichiers nécessaires depuis la source en conservant leur arborescence avant de poursuivre.
1. Télécharger le fichier
Télécharger SKILL.mdDepuis la racine d’un projet de test, enregistrez le fichier sous .skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md, ou utilisez la commande suivante. Ce dossier sert à examiner la skill avant son installation.
Commande pour macOS/Linux ou WSL : un shell POSIX et curl sont nécessaires. Sous Windows sans WSL, utilisez le bouton de téléchargement et créez le dossier manuellement.
mkdir -p '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e' && curl --fail --show-error --location 'https://skills-guides.com/api/skills/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/download' --output '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md.part' && mv '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md.part' '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md'2. Vérifier les prérequis
Lisez SKILL.md avant de l’utiliser. Si le fichier cite des scripts ou services externes, examinez-les et préparez les accès nécessaires dans votre environnement de test.
Outils déclarés par l’auteur (à vérifier dans votre agent) : Bash
Aucune section de prérequis reconnue dans ce fichier. Cela ne signifie pas qu’il est autonome : les bibliothèques, outils et accès peuvent être cités ailleurs dans le contenu ou dans le dépôt source.
Les plateformes de la fiche sont des indications du catalogue. Les chemins ci-dessous suivent la documentation des outils ; ils ne prouvent pas que cette skill y a été exécutée. Aucune version minimale de ces outils n’est attestée pour cette fiche.
3. Charger la skill
Après vérification, copiez le dossier complet dans le projet avec l’une des commandes ci-dessous, puis ouvrez une nouvelle session de l’outil. La commande s’arrête si un dossier du même nom existe déjà : comparez les fichiers avant de le remplacer.
Claude Code
test -f '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md' && test -s '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md' && mkdir -p '.claude/skills' && test ! -e '.claude/skills/trioexplorer' && cp -R '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e' '.claude/skills/trioexplorer'Cursor
test -f '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md' && test -s '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md' && mkdir -p '.cursor/skills' && test ! -e '.cursor/skills/trioexplorer' && cp -R '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e' '.cursor/skills/trioexplorer'Codex
test -f '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md' && test -s '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md' && mkdir -p '.agents/skills' && test ! -e '.agents/skills/trioexplorer' && cp -R '.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e' '.agents/skills/trioexplorer'OpenSkills
OpenSkills doit déjà être installé. La procédure locale install/read est contrôlée avec OpenSkills 1.5.0, qui exige Node.js ≥ 20.6.0. Aucun slug du catalogue n’est résolu automatiquement.
Installation officielle d’OpenSkillsopenskills install './.skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e'openskills read 'clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e'La lecture doit afficher le contenu du fichier installé et son dossier de base. Elle ne lance ni la skill ni ses dépendances.
Pour un agent qui lit AGENTS.md, synchronisez ensuite l’index. Cette commande modifie AGENTS.md : relisez le diff avant de l’utiliser.
openskills syncMode manuel ou autre outil : joignez SKILL.md à une conversation, ou ouvrez-le dans un agent capable de lire les fichiers. Ajoutez les ressources annexes nécessaires. Il n’existe pas de dossier universel reconnu par tous les outils.
4. Faire un premier essai
Utilisez une entrée courte et fictive : un endpoint d’API, un petit document ou un brief d’interface. Dans une nouvelle conversation, joignez le fichier ou donnez son chemin à l’agent, puis adaptez cette demande :
Lis .skill-downloads/clinical-notes-search-with-trioexplorer-mmio713e/SKILL.md et applique ses instructions à cet exemple : [décrire une entrée de test]. Indique les fichiers, dépendances ou accès qui manquent. Produis le résultat demandé par la skill sans inventer de données ni exécuter de script non examiné.Résultat attendu : une sortie correspondant aux instructions de la skill, ou une liste précise des prérequis manquants. Une simple confirmation de lecture ne valide pas le premier usage. Si une ressource externe est indisponible, ce parcours reste à tester.
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